健康危機管理において最も重要な点は発生を未然に防ぐことである。健康危機管理ガイドラインでは平常時の備えとして、健康危機情報を迅速に把握できる体制の確保があげられている。健康被害の発生動向の把握のための平常時からの監視で、法令に基づき感染症発生動向調査を実施している。